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大白菜EST-SSR標記開發(fā)中非SSR標記的鑒別

時間:2023-04-26 18:23:14 工業(yè)農(nóng)業(yè)論文 我要投稿
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大白菜EST-SSR標記開發(fā)中非SSR標記的鑒別

EST-SSR標記開發(fā)過程中經(jīng)常會遇到一些問題,例如引物重復設計等.本試驗對從大白菜EST序列中開發(fā)的30個多態(tài)性SSR標記產(chǎn)生的多態(tài)性條帶進行測序,結果發(fā)現(xiàn)有一些標記的多態(tài)性并不是由于其所含有的簡單重復序列重復次數(shù)的改變引起的,這類標記約占鑒定標記總數(shù)的13%.這些標記實際上屬于EST-SCAR標記.在進行SSR變異對基因表達及功能影響方面的研究時,這類非SSR標記應該被排除.

作 者: 周新成 劉立峰 李化銀 高建偉   作者單位: 山東省農(nóng)業(yè)科學院蔬菜研究所,山東,濟南,250100  刊 名: 山東農(nóng)業(yè)科學  ISTIC 英文刊名: SHANDONG AGRICULTURAL SCIENCES  年,卷(期): 2010 ""(4)  分類號: S634.1 Q503  關鍵詞: EST-SSR   標記開發(fā)   多態(tài)性   測序   大白菜  

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