四個DNA片段在山茶屬分子系統學研究中的應用

選取山茶屬14個組中的10組21種植物對目前常用于屬內種間的4個DNA片段(ITS、waxy、tmL-F、rpL16)進行序列測定.結果表明:(1)來自葉綠體基因組的2個片段(trnL-F、rpL16)其PCR擴增和測序都很容易,但兩者的進化速率都非常慢,序列矩陣只有很少信息位點(tmL-F含9個,rpL16為20個),不能提供必要的系統發育信息.(2)來自核基因組的ITS片段其PCR產物比較容易獲得,但其序列的測定存在較多問題.(3)waxy是來自核基因組的另一個片段,其PCR擴增因受模板DNA的數量和質量的影響很大而有一定難度,但其進化速率較快,序列矩陣具有較多信息位點(92個),并且在山茶屬是單拷貝,這對于解決山茶屬這類具有許多近緣物種的類群的系統關系有重要價值.基于tsnL-F、rpL16和waxy三組數據所建分子系統樹支持山茶屬為一單系,但屬下系統由于取樣等原因有待進一步研究.

作 者： 楊俊波 李洪濤 楊世雄 李德銖 楊瑩燕 YANG Jun-Bo LI Hong-Tao YANG Shi-Xiong LI De-Zhu YANG Yun-Yan   作者單位： 楊俊波,YANG Jun-Bo(中國科學院昆明植物研究所生物多樣性與生物地理學重點實驗室,云南,昆明,650204;中國科學院研究生院,北京,100039)

李洪濤,楊世雄,李德銖,楊瑩燕,LI Hong-Tao,YANG Shi-Xiong,LI De-Zhu,YANG Yun-Yan(中國科學院昆明植物研究所生物多樣性與生物地理學重點實驗室,云南,昆明,650204) 

刊 名： 云南植物研究  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BOTANICA YUNNANICA  年，卷(期)： 2006 28(2)  分類號： Q946 Q949  關鍵詞： 山茶屬   DNA序列   進化速率   分子系統學  

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