三種貓科動物MHC Class Ⅱ DRB等位基因序列變異性分析

分析了云豹(Neofelis nebulosa)、豹(Panthera pardus)和東北虎(Panthera tigris altaica)等3種貓科動物的主要組織相容性復合物ClassⅡDRB座位的等位基因序列變異性.使用一對簡并性引物擴增了DRB座位第二外元目標片段.用單鏈構像多態性分析方法確定不同的單倍型.每個個體挑出15個單克隆用來分離、純化和測序.實驗中從4個個體中獲得了8種不同序列.237 bp核苷酸序列中發現有59個變異位點.根據人類的抗原肽結合區推測79個氨基酸位點中存在21個假定的抗原肽結合位點,而且非同義替換率明顯高于同義替換率,這可能說明了第二外元的較高變異性是由平衡選擇作用來維持的.重建的NJ樹和MP樹顯示豹和東北虎的親緣關系較近,而兩者與云豹的親緣關系較遠.

作 者： 王倩 吳孝兵 晏鵬 WANG Qian WU Xiao-bing YAN Peng   作者單位： 安徽師范大學,生命科學學院,重要生物資源保護與利用安徽省重點實驗室,安徽,蕪湖,241000  刊 名： 動物學研究  ISTIC PKU 英文刊名： ZOOLOGICAL RESEARCH  年，卷(期)： 2006 27(2)  分類號： Q959.838 Q959.838.03  關鍵詞： MHC基因   DRB座位   第二外元   貓科動物   變異性  

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