植物類金屬硫蛋白半胱氨酸富含區結構的建模

詳細了解蛋白質的三級結構信息有助于理解其生物學功能.隨著植物基因組研究的進展,已發現了50多個植物類金屬硫蛋白(Metallothionein-Like, MT-L)基因.但至今只有少數幾個MT-L蛋白得到了純化,而其結構尚無報道,因此有必要建立分析這類蛋白結構特征的方法.本研究根據已知的哺乳動物MT的結構數據,分析得出了CXC、CXXC模式和金屬-硫絡合簇結構原子間的距離限制條件,并用距離幾何算法計算得出預測蛋白可能的構象;然后通過統計分析篩選出目標函數值顯著較小、構象能低的結構作為這些蛋白半胱氨酸富含區的預測結構,由此建成了適合于植物類金屬硫蛋白半胱氨酸富含區的結構預測方法.從應用該方法正確地預測出了已知結構的藍蟹MT的結構來看,該方法是可行的.并用該方法預測了油菜MT-L蛋白的半胱氨酸富含區的結構.

作 者： 何紅珍 朱春明 呂暾 張日清 趙南明 劉進元   作者單位： 清華大學生物科學與技術系,生物膜與膜生物工程國家重點實驗室,北京,100084  刊 名： 植物學報  ISTIC SCI 英文刊名： ACTA BOTANICA SINICA  年，卷(期)： 2002 44(10)  分類號： Q945  關鍵詞： 植物類金屬硫蛋白   半胱氨酸富含區   三級結構預測   距離幾何算法   plant metallothionein-like protein   cysteine rich domain   tertiary structure prediction   distance geometry algorithm  

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