- 相關推薦
氨基酸非鍵作用指數用于HLA-A*0201限制性CTL表位定量預測研究
目的 預測SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位.方法 從分子的三維空間結構出發,基于靜電、立體、疏水這三類與生物活性直接相關的非鍵作用方式,經主成分分析技術(PCA)得到了一種新的分子結構表達方法--氨基酸非鍵作用指數.利用該指數結合偏最小二乘(PLS)算法對152個HLA-A*0201限制性CTL表位進行了定量構效關系(QSAR)建模,再使用該模型對SSX-1和SSX-4抗原HLA.A*0201限制性表位進行預測.結果 預測出8個活性值大于7的九肽表位.結論 通過對SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位的預測,從而為SSX-1和SSD-4抗原HLA-A*0201限制性表位的實驗探測和鑒定打下了基礎.
周鵬,李聲時,ZHOU Peng,LI Sheng-shi(湖南大學化學生物傳感與計量學國家重點實驗室,長沙,410082;重慶大學化學化工學院,重慶,400044)
刊 名: 免疫學雜志 ISTIC PKU 英文刊名: IMMUNOLOGICAL JOURNAL 年,卷(期): 2007 23(4) 分類號: O641.12 關鍵詞: SSX-1 SSX-4 氨基酸非鍵作用指數 HLA-A*0201 CTL表位 定量構效關系【氨基酸非鍵作用指數用于HLA-A*0201限制性CTL表位定量預測研究】相關文章:
氨基酸廣義疏水標度(GH-scale)用于HLA-A*0201限制性CTL表位定量預測04-26
限制性和非限制性定語從句05-04
斷鍵與非鍵電子學的理論及應用研究初探04-26
基于非平穩時間序列的陀螺漂移性能建模與預測方法研究04-26
鍋爐的定性定量安全評價方法研究04-27
流域生態服務補償定量標準研究04-26
河流水污染定量研究進展04-27
基于人工神經網絡的結構腐蝕損傷定量預測04-27
淺談預測地震的方法研究04-27