蛋白質組研究中離子阱串聯質譜數據搜庫結果解釋方法

基于離子阱串聯質譜儀的鳥槍法是一種高通量的蛋白質鑒定方法.得到的數據一般使用軟件SE-QUEST搜索蛋白質序列數據庫,得到肽段鑒定列表以及相應的打分.為了得到蛋白質鑒定列表,還需要進行肽段鑒定結果的過濾和假陽性率的計算,然后根據肽段鑒定結果組裝蛋白質列表.這兩個問題目前還沒有很好地解決.對已有的方法進行總結和比較,可以給搜庫結果解釋方法的選擇提供參考,對數據質量控制方法的改進也有所幫助.

作 者： 張紀陽 朱云平 謝紅衛 賀福初 ZHANG Ji-yang ZHU Yun-ping XIE Hong-wei HE Fu-chu   作者單位： 張紀陽,謝紅衛,ZHANG Ji-yang,XIE Hong-wei(國防科學技術大學機電工程與自動化學院,長沙,410073)

朱云平,賀福初,ZHU Yun-ping,HE Fu-chu(軍事醫學科學院放射與輻射醫學研究所,北京,100850;北京蛋白質組研究中心,北京,102206) 

刊 名： 生物物理學報  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BIOPHYSICA SINICA  年，卷(期)： 2006 22(4)  分類號： Q5  關鍵詞： SEQUEST   離子阱串聯質譜   數據質量控制   蛋白質鑒定  

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