采用粒子群優(yōu)化的基因轉錄差異分析模型

高通測序技術可以更加全面地檢測實驗樣本中基因轉錄水平,這使得對樣本間基因轉錄差異的分析精度越來越準確.根據通過DNA高通測序技術獲得的基因轉錄區(qū)內Pol Ⅱ蛋白個數,提出了兩個樣本間基因轉錄差異分析模型.該模型在考慮同一基因間轉錄差異的同時,引入了全基因的轉錄分布特性以提高模型分析精度.模型采用預測概率最大化統(tǒng)計算法進行參數求取.在概率最大化步驟中,由于難以得到模型參數解析解和提高算法效率,采用粒子群優(yōu)化算法直接進行求取模型參數數值解.乳腺癌實驗數據測試表明,該模型可有效分析不同樣本間基因轉錄差異.

作 者： 馮偉興 王科俊   作者單位： 哈爾濱工程大學模式識別與智能系統(tǒng)研究所,哈爾濱,150001  刊 名： 中國生物醫(yī)學工程學報  ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF BIOMEDICAL ENGINEERING  年，卷(期)： 2010 29(2)  分類號： Q332  關鍵詞： 基因   轉錄差異   粒子群   分析模型  

【采用粒子群優(yōu)化的基因轉錄差異分析模型】相關文章：

植物基因轉錄起始頻率分析04-26

幾種基因差異表達分析方法的比較04-29

甲狀腺轉錄因子-2持續(xù)表達的轉基因小鼠模型建立04-26

真核基因轉錄與轉錄調節(jié)相關復合物04-27

胚胎干細胞的基因轉錄調控04-30

藻類基因轉錄調控研究進展04-29

鵝基因PCR-SSCP分析條件優(yōu)化的研究04-27

基于粒子群優(yōu)化的靜電陀螺支承控制優(yōu)化設計04-30

基于粒子群算法的翼型優(yōu)化設計04-27

玉米O2/o2近等基因系胚乳中基因表達差異分析04-28