人SBK1 cDNA的克隆及其相互作用蛋白的篩選

首次克隆到人的SBK1(homo sapiens SH3-binding domain kinase 1,SBK1)的cDNA序列,并通過生物信息學的手段,電子克隆到人SBK1的基因組DNA序列.人的SBK1是鼠SBK1的直系同源物,兩者基因組DNA結構相似,均含有4個外顯子.人的sbk1基因ORF長1 275 bp,編碼424個氨基酸,而鼠的ORF長1 254 bp,編碼417個氨基酸.兩者編碼區的核苷酸序列同源性達87.7%,而氨基酸序列同源性達95.7%,在羧基端均有一個PV富集區,推測其能與含有SH3結構域的蛋白質結合.將RT-PCR所獲得的長度為1 610 bp的sbk1 cDNA序列搜索EST數據庫,進行電子延伸,最終獲得了約5kb的人sbk1全長mRNA序列,它與鼠的sbk1全長mRNA大小一致;通過比較基因組學發現UniGene族Hs.97837實際上代表了sbk1基因UniGene族Hs.460471的3'UTR區域,而不是代表了一個新的UniGene族.采用酵母雙雜交技術,以SBK1為"誘餌",獲得了與之相互結合的蛋白表皮生長因子受體EGFR和核孤兒受體蛋白NR4A1,它們之間的具體功能關系有待進一步研究.

作 者： 王平章 王欣 王峰 吳俊 WANG Ping-Zhang WANG Xin WANG Feng WU Jun   作者單位： 王平章,王峰,WANG Ping-Zhang,WANG Feng(國家人類基因組北方研究中心,北京,100176)

王欣,WANG Xin(中國醫學科學院基礎醫學研究所,北京,100005)

吳俊,WU Jun(國家人類基因組北方研究中心,北京,100176;上海睿星基因技術有限公司,上海,201203) 

刊 名： 中國生物化學與分子生物學報  ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY  年，卷(期)： 2006 22(4)  分類號： Q71  關鍵詞： SBK1   克隆   酵母雙雜交   相互作用  

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