植物SSR引物開發策略簡述

SSR是一種優秀的分子遺傳標記,已經廣泛應用到遺傳多樣性檢測、遺傳種質鑒定、遺傳連鎖圖譜構建、基因定位與標記輔助育種等多個領域.但SSR標記應用的前提是根據物種已知DNA序列設計特異引物,才能進行PCR擴增.對于大多數物種而言,目前獲得的基因組DNA及表達的cDNA序列還非常有限或者根本沒有.由此人們不斷的設計出各種方法以開發出盡可能多的SSR引物,本文簡要地介紹了基于序列數據設計和發展SSR引物的方法,這對于全基因組序列已經測序的或者已經擁有豐富DNA數據的物種是非常快捷的策略.對于那些遺傳背景復雜或知之甚少或基因組數據有限的物種,本文也系統的介紹了傳統的文庫法、富集法等開發SSR引物的策略.進一步的本文結合本實驗室的研究經驗,對FIASCO磁珠富集法和ISS-抑制PCR法進行了比較.

作 者： 陳懷瓊 隋春 魏建和 Chen Huaiqiong Sui Chun Wei Jianhe   作者單位： 中國醫學科學院和北京協和醫學院藥用植物研究所,北京,100193  刊 名： 分子植物育種  英文刊名： MOLECULAR PLANT BREEDING  年，卷(期)： 2009 7(4)  分類號： Q94  關鍵詞： SSR   引物開發策略   文庫法   富集法  

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